J-Kopplungs-gestützte Diederwinkelanalyse im Fettsäurebindungsprotein

Inhaltsverzeichnis

• Einleitung und Problemstellung
  • Das Fettsäurebindungsprotein (FABP)
  • Struktur des FABP
• Methoden
  • 3J-Kopplungen als Strukturparameter
  • Bestimmung von ³J-Kopplungskonstanten
  • Pulssequenz und Spektren
  • J-Kopplungskonstanten in MD-Simulationen
• Experimenteller Teil
  • NMR-Spektroskopie.
  • Auswertung der Spektren
  • Molekulardynamiksimulation.
• Ergebnisse
  • J-modulierte [15N, ¹H]-COSY-Spektren
  • 3JHNH-Kopplungskonstanten
  • Diederwinkelanalyse
• Diskussion und Ausblick
• Zusammenfassung
• Literatur
• Chemische Verschiebungen
• Programme
  • Pulsprogramm und Aquisitionsparameter
  • prepare.m
  • volumes.m
  • table.m
  • kopplung.m
  • ellipse.m
  • fct_hnha.m
  • zoom2d.m
  • cont2d.m

Zielsetzung und Themenschwerpunkte

Die vorliegende Diplomarbeit zielt auf die Untersuchung des Fettsäurebindungsproteins (FABP) mithilfe der NMR-Spektroskopie ab. Die Arbeit untersucht die strukturellen Eigenschaften des FABP durch die Analyse von J-Kopplungskonstanten, die aus NMR-Spektren gewonnen werden.

• Struktur des FABP
• Analyse von J-Kopplungskonstanten
• NMR-Spektroskopie und Molekulardynamiksimulation
• Diederwinkelanalyse
• Struktur-Funktionsbeziehung im FABP

Zusammenfassung der Kapitel

Die Arbeit beginnt mit einer Einleitung, die das Fettsäurebindungsprotein (FABP) und seine Bedeutung in biologischen Prozessen beschreibt. Anschließend werden die Methoden der NMR-Spektroskopie und der Molekulardynamiksimulation vorgestellt, die zur Analyse der Struktur des FABP eingesetzt werden. Der experimentelle Teil der Arbeit beschreibt die Durchführung der NMR-Messungen und die Auswertung der erhaltenen Spektren. Im Kapitel "Ergebnisse" werden die Ergebnisse der J-Kopplungsanalyse und die daraus abgeleiteten Diederwinkel präsentiert. Abschließend werden die Ergebnisse diskutiert und die Bedeutung der gewonnenen Erkenntnisse für das Verständnis der Struktur und Funktion des FABP erläutert.

Schlüsselwörter

Fettsäurebindungsprotein, NMR-Spektroskopie, J-Kopplung, Diederwinkelanalyse, Molekulardynamiksimulation, Struktur-Funktionsbeziehung, Proteinstruktur, Biophysik.