Chemische und enzymatische Synthese modifizierter Nukleinsäuren für die Analytik mit Hilfe der MALDI-TOF Massenspektrometrie

Inhaltsverzeichnis

• Einleitung
• Wachsende Bedeutung der DNA-Analytik
• Nachteile klassischer Methoden der DNA-Analytik
• MALDI-TOF Massenspektrometrie zur Analyse von Biomolekülen
• Massenspektrometrie von Nukleinsäuren
• Problemstellung
• Ergebnisse und Diskussion
• Einführung
• Das Pyrrolo[2,3-d]pyrimidinsystem
• Biologische Bedeutung
• Nomenklatur
• Synthese von 7-Deaza-2'-desoxyguanosin und 7-Deaza-2'-desoxyadenosin
• Darstellung der Aglykone
• Synthese geeigneter Akzeptoren für Glykosidierungsreaktionen
• Synthese von Glykosyldonoren
• Glykosidierungsreaktionen
• Abspaltung der Schutzgruppen aus den Glykosidierungsprodukten
• Chemische Festphasensynthese von Oligodesoxynukleotiden
• Die Phosphoamiditmethode
• Darstellung von Monomeren für die DNA-Synthese.
• Benzoyl- und Isobutyryl-Gruppe als exozyklische Aminoschutzgruppen.
• Aminogruppen
• 4-tert-Butylphenoxyessigsäure als Schutzgruppe für exozyklische Aminogruppen
• Festphasengebundene Synthese modifizierter Nukleinsäuren
• Enzymatische Darstellung modifizierter Nukleinsäuren
• Die Polymerasekettenreaktion
• Wahl von Primer-Template-Systemen für die PCR.
• Wahl einer geeigneten DNA-Polymerase für die PCR
• Erfolgreicher Einbau der modifizierten Triphosphate

Zielsetzung und Themenschwerpunkte

Die Dissertation befasst sich mit der chemischen und enzymatischen Synthese modifizierter Nukleinsäuren. Das Ziel der Arbeit ist es, neue Methoden zur Darstellung modifizierter Nukleinsäuren zu entwickeln, die sich für die Analyse mit Hilfe der MALDI-TOF Massenspektrometrie eignen.

• Synthese von 7-Deaza-2'-desoxyguanosin und 7-Deaza-2'-desoxyadenosin
• Chemische Festphasensynthese von Oligodesoxynukleotiden
• Enzymatische Darstellung modifizierter Nukleinsäuren
• Anwendung der MALDI-TOF Massenspektrometrie zur Analyse von modifizierten Nukleinsäuren
• Entwicklung neuer Methoden zur Verbesserung der Analytik von Nukleinsäuren

Zusammenfassung der Kapitel

Die Einleitung führt in die Thematik der DNA-Analytik ein und erläutert die wachsende Bedeutung dieses Forschungsgebietes. Anschließend werden die Nachteile klassischer Methoden der DNA-Analytik beschrieben und die Vorteile der MALDI-TOF Massenspektrometrie für die Analyse von Biomolekülen aufgezeigt.

Das Kapitel "Ergebnisse und Diskussion" konzentriert sich auf die Synthese von 7-Deaza-2'-desoxyguanosin und 7-Deaza-2'-desoxyadenosin sowie deren Einbau in Oligodesoxynukleotide. Die Arbeit beschreibt sowohl die chemische Festphasensynthese als auch die enzymatische Darstellung modifizierter Nukleinsäuren. Es werden verschiedene Aspekte der Synthesemethoden detailliert behandelt, wie z. B. die Wahl von Schutzgruppen und die Optimierung der Reaktionsbedingungen.

Schlüsselwörter

Die Dissertation behandelt die Synthese und Analyse modifizierter Nukleinsäuren, wobei der Fokus auf der Verwendung von MALDI-TOF Massenspektrometrie liegt. Die Arbeit beinhaltet wichtige Themen wie die Synthese von 7-Deaza-2'-desoxyguanosin und 7-Deaza-2'-desoxyadenosin, die Festphasensynthese von Oligodesoxynukleotiden, die enzymatische Darstellung modifizierter Nukleinsäuren und die Anwendung der MALDI-TOF Massenspektrometrie in der Analytik.